生物學性狀
（一）形態與染色
大小為0.5～0.7×2～3μm，無芽胞，無莢膜，無鞭毛。多數有菌毛。革蘭氏陰性桿菌。
（二）培養特性
為兼性厭氧菌，能在普通培養基上生長，形成中等大小，半透明的光滑型菌落。在腸道桿菌選擇性培養基上形成無色菌落。
（三）生化反應
分解葡萄糖，產酸不產氣。VP試驗陰性，不分解尿素，不形成硫化氫，不能利用枸櫞酸鹽作為碳源。宋內氏志賀氏菌能遲緩發酵乳糖（37℃3～4天）。
（四）抗原構造與分類
有K和O抗原而無H抗原。K抗原是自患者新分離的某些菌株的菌體表面抗原，不耐熱，加熱100℃1小時被破壞。K抗原在血清學分型上無意義，但可阻止O抗原與相應抗血清的凝集反應。O抗原分為群特異性抗原和型特異性抗原，前者常在幾種近似的菌種間出現；型特異性抗原的特異性高，用物區別菌型。
（1）A群:又稱痢疾志賀氏菌（Sh.dysenteriae）,通稱志賀氏痢疾桿菌。不發酵甘露醇。有12個血清型，其中8型又分為三個亞型。
（2）B群：又稱福氏志賀氏菌（Sh.flexneri），通稱福氏痢疾桿菌。發酵甘露醇。有15個血清型（含亞型及變種），抗原構造復雜，有群抗原和型抗原。根據型抗原的不同，分為6型，又根據群抗原的不同將型分為亞型；X、Y變種沒有特異性抗原，僅有不同的群抗原。
（3）C群：又稱鮑氏志賀氏菌（Sh.boydii），通稱鮑氏痢疾桿菌。發酵甘露醇，有18個血清型，各型間無交叉反應。
（4）D群：又稱宋內氏志賀氏菌（Sh.sonnei），通稱宋內氏痢疾桿菌。發酵甘露醇，并遲緩發酵乳糖，一般需要3～4天。只有一個血清型。有兩個變異相，即Ⅰ相和Ⅱ相；Ⅰ相為S型，Ⅱ相為R型。
根據志賀氏菌的菌型分布調查，我國一些主要城市在過去二、三十年中均以福氏菌為主，其中以又2a亞型、3型多見；其次為宋內氏菌；志賀氏菌與鮑氏菌則較少見。了解菌群分布與菌型變遷情況，對制備菌苗，預防菌痢具有重大意義。
（五）抵抗力
本菌對理化因素的抵抗力較其他腸道桿菌為弱。對酸敏感，在外界環境中的抵抗力能以宋內氏菌zui強，福氏菌次之，志賀氏菌zui弱。一般56～60℃經10分鐘即被殺死。在37℃水中存活20天，在冰塊中存活96天，蠅腸內可存活9～10天，對化學消毒劑敏感，1%石碳酸15～30分鐘死亡。
（六）變異
1．S-R型變異：宋內氏痢疾桿菌易為R型。當菌落變異時，常伴有生化反應、抗原構造和致病性的改變。
2．耐藥性變異：由于廣泛使抗生素，志賀氏菌的耐藥菌株不斷增加，給防治工作帶來多困難。
3．營養缺陷型變異：南斯拉夫Mel（1963年）*的依賴鏈霉素的志賀氏菌株（依鏈株，Sd），作為口服菌苗可預防志賀氏菌痢疾。
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